BIOSYS - Ottimizzazione, modellistica e algoritmi per la bioinformatica e la systems biology (DIT.AD021.016)

Thematic area

Engineering, ICT and technologies for energy and transportation

Project area

Structure responsible for the research project

Institute for system analysis and computer science "Antonio Ruberti" (IASI)

Project manager

DANIELE SANTONI
Phone number: 0649937119
Email: daniele.santoni@iasi.cnr.it

Abstract

Vengono sviluppati metodi di modellazione matematica e di ottimizzazione ed algoritmi di soluzione e tools informatici per problemi nella biomatematica, nella bioinformatica e nella system biology. Le metodologie studiate sono: programmazione lineare e intera, metodi combinatorici, teoria dei sistemi e del controllo, apprendimento supervisionato e non supervisionato per problemi di analisi dei dati e data mining, teoria dei grafi e delle stringhe, teoria degli algoritmi e delle strutture dati e delle basi di dati. Questo con l'obiettivo da una parte di identificare e verificare modelli (dinamici, o di classificazione) di fenomeni biologici a livello molecolare, cellulare e di tessuti, formulati a partire dai molti dati sperimentali oggi disponibili in genomica, transcrittomica, proteomica e metabolomica, dall'altra di analizzare e predire strutture primarie, secondarie e terziarie di DNA, RNA e Proteine e reti di molecole. I risultati del progetto consistono nell'avanzamento della conoscenza su diversi fenomeni biologici, nello sviluppo di nuovi metodi di analisi, e di relativi strumenti computazionali da condividere con la comunità scientifica.

Goals

Dal punto di vista metodologico:
contributo allo sviluppo in Italia della nuove aree di ricerca a carattere interdisciplinare fra matematica, informatica e statistica e le scienze della vita e della salute;
formazione di nuove competenze di tipo interdisciplinare nei settori suddetti.

Dal punto di vista applicativo:
diagnostica precoce;
classificazione di microroganismi;
analisi di regolazione dell'espressione genica;
analisi del panorama mutazionale di virus;

Start date of activity

01/01/2016

Keywords

Bioinformatica, System Biology, Ottimizzazione

Last update: 25/04/2024