Progetto di ricerca

BIOSYS - Ottimizzazione, modellistica e algoritmi per la bioinformatica e la systems biology (DIT.AD021.016)

Area tematica

Ingegneria, ICT e tecnologie per l'energia e i trasporti

Area progettuale

Matematica Applicata (DIT.AD021)

Struttura responsabile del progetto di ricerca

Istituto di analisi dei sistemi ed informatica "Antonio Ruberti" (IASI)

Responsabile di progetto

DANIELE SANTONI
Telefono: 0649937119
E-mail: daniele.santoni@iasi.cnr.it

Abstract

Vengono sviluppati metodi di modellazione matematica e di ottimizzazione ed algoritmi di soluzione e tools informatici per problemi nella biomatematica, nella bioinformatica e nella system biology. Le metodologie studiate sono: programmazione lineare e intera, metodi combinatorici, teoria dei sistemi e del controllo, apprendimento supervisionato e non supervisionato per problemi di analisi dei dati e data mining, teoria dei grafi e delle stringhe, teoria degli algoritmi e delle strutture dati e delle basi di dati. Questo con l'obiettivo da una parte di identificare e verificare modelli (dinamici, o di classificazione) di fenomeni biologici a livello molecolare, cellulare e di tessuti, formulati a partire dai molti dati sperimentali oggi disponibili in genomica, transcrittomica, proteomica e metabolomica, dall'altra di analizzare e predire strutture primarie, secondarie e terziarie di DNA, RNA e Proteine e reti di molecole. I risultati del progetto consistono nell'avanzamento della conoscenza su diversi fenomeni biologici, nello sviluppo di nuovi metodi di analisi, e di relativi strumenti computazionali da condividere con la comunità scientifica.

Obiettivi

Dal punto di vista metodologico:
contributo allo sviluppo in Italia della nuove aree di ricerca a carattere interdisciplinare fra matematica, informatica e statistica e le scienze della vita e della salute;
formazione di nuove competenze di tipo interdisciplinare nei settori suddetti.

Dal punto di vista applicativo:
diagnostica precoce;
classificazione di microroganismi;
analisi di regolazione dell'espressione genica;
analisi del panorama mutazionale di virus;

Data inizio attività

01/01/2016

Parole chiave

Bioinformatica, System Biology, Ottimizzazione

Ultimo aggiornamento: 28/03/2024