Institute of molecular genetics (IGM)

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Principali collaborazioni

Commessa ME.P04.004
Sviluppo e meccanismo d'azione di analoghi nucleotidici e nucleosidici come composti antiproliferativi e antivirali : nuovi composti e nuovi bersagli per la terapia

Contratti UE:
6FP-LSHB-CT-2003-503480: Targeting Replication and
Integration of HIV

6FP-LSHP-CT-2006-037257: Exploiting cellular export of nuclear transcripts as HIV innovative therapy

ISS-VI_PROGRAIDS-Conv.40G36: Ruolo funzionale della proteina vif di hiv-1 nel processo di retrotrascrizione virale"

Contratti FIRB:
RBAU01LSR4_001

RBNE01J3SK_003

Università degli Studi di Pavia- Dip. Medicina Sperimentale - Sez. Patologia Generale
Proff. Vanio Vannini, Lucia A. Stivala
Oggetto: Caratterizzazione del meccanismo antiproliferativo del resveratrolo su cellule umane.

IRCCS Policlinico S.Matteo-Serv. Virologia, Pavia
Prof. Giuseppe Gerna, Dr. Fausto Baldanti, Dr.ssa Stefania Paolucci
Oggetto: Caratterizzazione dei meccanismi di resistenza farmacologica del virus HIV-1 ad inibitori della trascrittasi inversa.

Università degli Studi di Siena- Dip. Farmaco-Chimico Tecnologico, Siena
Prof. Maurizio Botta, Prof. Federico Corelli
Oggetto: Identificazione di nuovi inibitori della trascrittasi inversa del virus HIV-1
Oggetto: Identificazione di nuovi inibitori delle tirosine chinasi della famiglia Src.
Oggetto: Identificazione di nuovi inibitori della Purina nucleoside fosforilasi umana.

European Center for Drug Discovery NatSynDrugs, Siena
Prof. Giuseppe Campiani
Oggetto: Identificazione di nuovi inibitori della trascrittasi inversa del virus HIV-1
Oggetto: Identificazione di nuovi inibitori della elicasi NS3 del virus HCV
Oggetto: Identificazione di nuovi inibitori dell'adenosina chinasi umana

Università degli Studi di Roma -La Sapienza, Dipartimento Studi Farmaceutici, Roma
Proff. Marino Artico, Roberto DiSanto, Antonello Mai, Romano Silvestri
Oggetto: Identificazione di nuovi inibitori della trascrittasi inversa del virus HIV-1

Università delgi Studi di Messina- Dipartimento Farmaco-Chimico, Messina
Prof.ss Alba Chimirri
Oggetto: Identificazione di nuovi inibitori della trascrittasi inversa del virus HIV-1

Ist. Superiore di Sanità-Roma
Dr.ssa Eugenia Dogliotti, Dr. Marco Crescenzi, Dr.ssa Margherita Bignami
Oggetto: Caratterizzazione biochimica di complessi multiproteici competenti per la riparazione del DNA da cellule umane

Istituto di Biochimica delle Proteine IBP-CNR, Napoli
Prof. Mosè Rossi, Dr.ssa Francesca Pisani
Oggetto: Cratterizzazione funzionale dell'interazione tra DNA polimerasi umane e loro proteine accessorie.

Aziende Chimiche Riunite Angelini Francesco A.C.R.A.F. S.p.A.
Dott.ssa Giorgia Mangano
Oggetto: Screening di potenziali inibitori della Purina Nucleoside Fosforilasi umana (hPNP)

Collaborazioni Esterne con Enti di Ricerca Stranieri:

Heriot-Watt University- Chemistry, School of Engineering & Physical Sciences, Edinburgh (UK)
Prof. Nicola Howarth
Oggetto: Identificazione di nuovi inibitori della trascrittasi inversa del virus HIV-1

Katholieke Universiteit Leuven- Laboratory for Molecular Virology and Drug Discovery, Leuven (Belgium)
Prof. Myriam Witvrouw
Oggetto: Identificazione di nuovi inibitori della trascrittasi inversa del virus HIV-1

Engelhardt Institute of Molecular Biology -Russian Academy of Sciences, Moscow (Russia)
Prof. Marina Kukhanova
Oggetto: Identificazione di nuovi inibitori delle DNA polimerasi eucariotiche

Institute of Chemical Biology and Fundamental Medicine -Russian Academy of Sciences, Novosibirsk (Russia)
Prof. Olga Lavrik
Oggetto: Caratterizzazione biochimica di complessi multiproteici competenti per la riparazione del DNA da cellule umane

Université Pierre et Marie Curie- UMR 7098 - Biochimie Cellulaire, Paris (France)
Prof. Joëlle Sobczak-Thepot
Oggetto: Ruolo della ciclina A nella regolazione della fase S delle cellule di mammifero.

University of Zürich-Irchel, Inst. of Veterinary Biochemistry & Molecular Biology, Zürich (Switzerland)
Prof. Ulrich Hübscher
Oggetto: Cratterizzazione funzionale dell'interazione tra DNA polimerasi umane e loro proteine accessorie.

Institute of Pharmacology and Structural Biology IPBS-CNRS, Toulouse (France)
Dr. Giuseppe Villani
Oggetto: Cratterizzazione funzionale dell'interazione tra DNA polimerasi umane e loro proteine accessorie.

GLSynthesis, Inc MA USA
Prof. George E. Wright (President)
Oggetto: Identificazione di nuovi inibitori della timidina chinasi del virus erpetico BV.


Commessa ME.P05.005
Malattie genetiche dovute a difetti nella riparazione del DNA che predispongono ai tumori. Analisi genetica funzionale dei fattori importanti per l'integrità del genoma.

PARTNER

Dip di Genetica e Microbiologia, Università degli Studi di Pavia
Dip di Scienze Biomolecolari e Biotecnologie, Università degli Studi di Milano
Istituto Ricerche Farmacologiche Mario Negri, Milano
Istituto di Statistica Medica e Biometria, Facoltà di Medicina e Chirurgia, Università degli Studi di Milano
Fondo Edo Tempia per la lotta contro i tumori, Biella
Istituto Nazionale per la Ricerca sul Cancro, Department of Translational Oncology, Genova
Laboratory of Molecular and Cell Biology, Istituto Dermopatico dell'Immacolata, Roma
Dept of Environment and Primary Prevention, Istituto Superiore di Sanità, Roma

Dept of Cell Biology and Dept of Clinical Genetics, Erasmus University MC, Rotterdam, The Netherlands
Genome Damage and Stability Centre, University of Sussex, Brighton, UK
Institut de Genetique et de Biologie Moleculaire et Cellulaire, CNRS/INSERM, Strasbourg, Francia
Institut Gustave Roussy, CNRS, Villejuif, Francia
Ecole Normale Supérieure de Lyon, Francia
Basic Research Laboratory, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, Bethesda, USA
Dept of Molecular Genetics and Biochemistry, University of Pittsburgh Cancer Institute, Pittsburgh, USA
Dept of Biostatistics, Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health, Baltimore, USA
Department of Biological Sciences, Stanford University, Stanford, USA

ATTUALI COMMITTENTI

FONDAZIONE CARIPLO
1) Patogenomica di tre malattie ereditarie difettive nella riparazione del DNA e nella trascrizione, 2004.1543/10.8441
2) Controllo Genetico ed Epigenetico della Stabilità del Genoma, Progetto Nobel

COMUNITÀ EUROPEA
1) DNA Repair and human health, MRTN-CT-2003-503618
2) Rare genetic skin diseases, 6 FP, LSHM-CT-2005-512117

MINISTERO DELL'ISTRUZIONE, DELL'UNIVERSITÀ E DELLA RICERCA
1) Analisi funzionale di geni patologici implicati nel mantenimento dell'integrità del genoma, FIRB RBNE01RNN7
2) In vitro and in vivo models to investigate the molecular mechanisms of oxidative DNA damage and repair, Progetti di cooperazione scientifica e tecnologica recepiti negli accordi Italia-USA, RBIN042YJ7
3) Nuovi sistemi cellulari per lo studio della riparazione delle rotture a doppia elica del DNA in cellule di mammifero, RBAU01ZB78

MINISTERO SANITÀ
Avanzamenti diagnostici nelle malatie ereditarie della cute, Protocollo d'intesa Italia-USA, Progetto di Ricerca su Malattie rare, convenzione 526/A29 IDI-CNR

TELETHON
Dissecting the genetic basis and molecular mechanisms of Premature Ovarian Failure (POF)

ASSOCIAZIONE ITALIANA PER LA RICERCA SUL CANCRO
DNA repair disease

Commessa ME.P05.006
Cromosomi artificiali per terapia genica. Studi sulla replicazione del DNA in cellule umane; controllo del ciclo cellulare e della proliferazione.

1) International Center for Genetic Engineering and Biotechnology-Trieste
2) Dipartimento di Scienze Biomolecolari e Biotecnologie- Università di Milano
3) MRC- Human Genetics Unit- Chromosome Biology Section-Edinburgo GB
4) Istituto di Biochimica delle Proteine-CNR- Napoli
5) Istituto Internazionale di Genetica e Biofisica- CNR- Napoli
6) U598 INSERM, Parigi, Francia
7) Istituto Nazionale Tumori, Milano
8) Dipartimento di Biologia Cellulare, Università di Pavia
9) Dipartimento di Studi Farmaceutici, Università La Sapienza, Roma
10) Istituto Superiore di Sanità - Roma
11) Department of Biological Sciences - California State University,
12) Dipartimento di Biochimica - Università di Bologna
13) Dipartimento di Biologia Strutturale e Funzionale- Università dell'Insubria - Busto Arisizio
14) Dipartimento di Genetica e Microbiologia- Università di Pavia

Commessa ME.P06.010
Sviluppi metodologici in citometria e applicazioni alla sperimentazione biomedica; in vitro imaging

a) Collaborazioni con istituti in grado di fornire il necessario supporto tecnologico-strumentale (Dip. Elettronica per l'Automazione, UniBS; Dip. Fisica Sanitaria, Ist. Tumori Milano, Ditta FIBERLAN, Milano) e biomedico (Dip. Medicina Interna Sez. Farmacologia, UniPV; Neurochirurgia, Parma; Chirurgia Generale, PD).

b) Laboratorio citometria Ist. Mario Negri. Milano; Centro Citometria Univ. Urbino; Ditta FRAEN (MI).

c) Max Delbruck Center for Molecular Medicine, Università di Berlino (Dr. M.C. Cardoso). LBCMCP, Université P. Sabatier, Toulouse, Francia (Prof. B. Ducommun).

Commessa ME.P07.005.001
Genetica della popolazione italiana e meccanismi di evoluzione

Département de Mathématiques et de Statistique, Université de Montréal, Montréal, Canada.
Laboratori di Genetica Umana, Genetica di Popolazioni e Immunogenetica, Dipartimento di Genetica e Microbiologia, Università di Pavia.
Sezione di Biologia e Genetica, Dipartimento Materno-Infantile e di Biologia-Genetica, Facoltà di Medicina e Chirurgia, Università di Verona.
AVIS provinciali italiane.
Unità di Diabetologia, INRCA - Ancona.
Dipartimento di Statistica ed Economia Applicate "Libero Lenti", Università di Pavia.

Commessa SV.P13.001.001
Studio della regolazione post-trascrizionale dell'espressione genica in risposta a stress. Fattori che controllano lo splicing dei mRNA in cellule normali e nei tumori.

Prof. F: Baralle ICGEB - Trieste - Analisi di complessi ribonucleici
Prof. M. Biggiogera Università di Pavia - Microscopia elettronica
Prof. A: Pombo MRC - London - Analisi dei territori cromosomici
Prof. PM Comoglio - IRCCS Candiolo - Ruolo di SF2/ASF nella mobilità cellulare
Prof. Michael Green - Howard Hughes Medical Institute, University of Massachusetts Medical School, USA. Interazione tra SF2/ASF e trascritti di Ron
Prof. Jamal Tazi, Universités Université Montpellier II- Métabolisme des ARN messagers. Sviluppo di inibitori dello splicing alternativo di specifici geni da utilizzare per approcci terapeutici

Commessa ME.P03.012.001
Bersagli molecolari per il controllo della progressione tumorale

S. Gilmour, Animal Genomics, AgResearch, Hamilton, Nuova Zelanda: costrutti isoforme PKC;
RF. Irvine, Department of Pharmacology, Tennis Court Road, Cambridge, UK: anticorpi isoforme PLC;
A.R. Migliaccio, Laboratorio di Biochimica Clinica, Istituto Superiore di Sanità, Roma: modelli animali GATA1-low;
L. Cocco, Dipartimento di Scienze Anatomiche Umane e Fisiopatologia dell'Apparato Locomotore, Cell Signalling Laboratory, Università di Bologna: modelli cellulari e modulazione delle PLC nucleari;
S. Marmiroli, Dipartimento di Anatomia e Istologia, Università di Modena e Reggio Emilia, Modena: organizzazione del citoscheletro, ruolo di Akt;
L. Giuliani ISPESL- Roma: protocolli e normative di esposizione a NIR;
S. Grimaldi INMM-CNR Tor Vergata Roma: esposizione a NIR in camere schermate.

Commessa ME.P05.014.001
Patogenesi delle malattie degenerative muscolo-scheletriche

Prof P Bonaldo, Universita' di Padova
Dr E Bertini, OBG, (Istituto di Ricovero e Cura a Carattere Scientifico, IRCCS), Roma.
Dr P Guicheney, INSERM, Parigi

Prof. G. Novelli Università Tor Vergata, Roma
Prof. Roland Foisner, Max F. Perutz Laboratories, Medical University of Vienna, Austria.
Dr. G. Bonne INSERM, Parigi.
Dr. L. Gordon, Progeria Research Fundation, Boston, USA
Prof. David Araujo-Vilar, Universidade de Santiago de Compostela, Spain.
Dr. E. Lucarelli, Istituto Ortopedico Rizzoli, IRCCS Bologna
Dr. K. Scotlandi, Istituto Ortopedico Rizzoli, IRCCS Bologna

S. Avnet, Istituto Ortopedico Rizzoli, IRCCS Bologna
G Lisignoli, Istituto Ortopedico Rizzoli, IRCCS Bologna

Prof. David Araujo-Vilar, Università di Santiago de Compostela, Spagna
Network Italiano Laminopatie
ECLip, European Consortium for Lipodystrophies


Commessa ME.P06.012
Studio dell'interazione tra campi elettromagnetici e cellule eucariotiche

Modulo ME.P06.012.001: Studio dell'interazione tra campi elettromagnetici e cellule eucariotiche

ISPESL (committente)
Università "La Sapienza"

Modulo ME.P06.012.002: Protocolli di combinazioni di campi elettrici, magnetici ed elettromagnetici pulsati per il trasferimento di molecole ad attività farmacologica in vitro ed in vivo

ISPESL per la messa a punto del sistema espositivo e di elettroporazione
Prof. Vito Michele Fazio, Università Campus Bio-Medico di Roma
Facoltà di Medicina e Chirurgia per consulenza sulle molecole
farmacologiche.
Dr. A. Lisi per la Biologia Cellulare
Dr. E. Massi per la Biologia Molecolare
Stabulario Università Cattolica Sacro Cuore per l'eventuale uso in vivo su modello animale della nuova metodica.

Modulo ME.P06.012.003: Interazione tra frequenze di risonanza di ciclotrone di ioni e biosistemi

ISPESL-DIPIA - Roma
ISPESL - Venezia
Università "La Sapienza" - Roma
Università "Tor Vergata" - Roma
Istituto di Struttura della Materia CNR - Roma
Istituto di Fisiologia Clinica - Siena
Istituto di Genetica Molecolare IGM CNR - Bologna
Istituto Neurobiologia e Medicina Molecolare INMM CNR - Roma
Fondazione EBRI-Santa Lucia - Roma

Modulo ME.P06.012.005: Effetti delle radiazioni di risonanza di ciclotrone di ioni sulla proliferazione di cellule staminali ematopoietiche

INMM-CNR ROMA TOR-VERGATA Dr. Settimio Grimaldi (Committente)
IFC-CNR Siena Dr.ssa Caterina Cinti (Partner)
ISPESL - ROMA Dr Livio Giuliani (Partner)

Modulo ME.P06.012.006: Studio dell'interazione dei campi elettromagnetici con modelli di membrana cellulare

Principali collaboratori e committenze del Laboratorio "Interazione campi elettromagnetici e modelli membrana (ICEmM)" sono:

Annesini, M.C., Prof., Ing. Chimica, " La Sapienza" (Modelli dinamici e cinetiche enzimatiche)
D'Inzeo, G. Prof., Dir. Dip. Ing. Elettronica, "La Sapienza" (Meccanismi di interazione tra EMR e biosistemi)
Gallerano, G.P., Dr. UTS-FIS ENEA-Frascati (THz source Compact FEL- Fisica-Ottica)
ICEmB (Centro Interuniversitario Interazioni tra Campi Elettromagnetici e Biosistemi) in convenzione con l' INMM dal 1996.
Luisi, L., Prof., Dip. Biologia, Università Roma 3 (Liposomi giganti, sviluppo nuovi modelli)
Memoli, A. Prof. Farmacia, "La Sapienza" (Liposomi applicazioni analitiche e nuovi farmaci)
Villalobo, A., PhD, CSCI, University of Madrid, Spain (Biochimica, Gap junction)
Chamberlain, M. Prof., Dip. Fisica, University of Durham, UK (THz microscope, imaging- Fisica-Ottica)
Weightman, P., Prof., Dip. Fisica, University of Liverpool, UK (THz sources, 4GLS at Daresbury, UK)
Maria Rosaria Scarfì, Primo Ricercatore CNR-IREA (THz-BRIDGE Project-Effetti su colture cellulari)
Luigi Filippelli, Università della Calabria, (Studi 2-HNMR su sistemi modello fosofolipidi/Espositori 234 GHz)

Commessa PM.P04.007
Dispositivi multifunzionali avanzati basati su nanostrutture organiche e ibride e loro investigazione mediante sonde ottiche non convenzionali (DIMO)

Modulo PM.P04.007.001: Dispositivi multifunzionali avanzati basati su nanostrutture organiche e ibride e loro investigazione mediante sonde ottiche non convenzionali (DIMO)

Collaborazioni scientifiche:
IBM, Zurich (CH); IMEC, Leuven (B); AMO GmbH, Aachen (D); Philips-Einhdoven (NL); 3 Dag-Zurich (CH); Exitech-Oxford (UK); Centro Ricerche Plastoptica, Amaro (UD); CSEM- Zurich (CH); Università Northwestern (USA);
Università di Hong Kong; CNR-ISOF, CNR-IMEM, CNR-ITOI; INSTM - Milano, Firenze, Catania, Padova; Università di Milano; Università di Bologna; Università di Parma; Sincrotrone di Trieste; CNR Departimento

Materiali e Dispositivi
Committenti:
ELECTROLUX S.p.A., Sued Chemie S.p.A.

Modulo PM.P04.007.002-003: Imaging ottico in modelli bio e nanotecnologici

Dr. Marco Canossa del Dipartimento di Farmacologia dell'Università di Bologna
Prof.ssa Marialuisa Melli del Dipartimento di Biologia Evoluzionistica Sperimentale dell'Università di Bologna