FISR 2020 HackTheCoV (DSB.AD001.201)
Thematic area
Project area
Oncologia e Immunologia (DSB.AD001)Structure responsible for the research project
Institute of clinical physiology (IFC)
Project manager
SILVESTRO CONTICELLO
Phone number: 050 3152101
Email: silvoc@ifc.cnr.it
Abstract
Due sono gli obiettivi per la prima fase di questo progetto: 1) creare una mappa di regioni e siti specifici nel genoma SARS-CoV-2 che possano essere sfruttati per interventi terapeutici. 2) valutare se l'editing dell'RNA, una difesa innata contro i virus, sia rilevante per migliorare la risposta cellulare all'infezione. Background e Razionale L'identificazione di bersagli molecolari che possano essere sfruttati contro il SARS-CoV-2 passa attraverso l'acquisizione di conoscenze sulle proteine virali, sul loro ruolo e sul loro potenziale di diventare bersaglio per azioni di profilassi e terapia contro il virus. Di solito questo viene eseguito attraverso screening molecolari che caratterizzano e testano ogni componente virale. Un'altra opzione si basa sulla variabilità genetica naturale nell'interazione ospitepatogeno: la conoscenza del potenziale evolutivo del virus può essere sfruttata per identificare regioni in cui le mutazioni sono dannose. Tuttavia, nel caso di SARS-CoV-2 questa opzione è limitata (a) dal breve tempo trascorso dall'inizio dell'epidemia, per cui -nonostante i massicci sforzi di sequenziamento- non ci sono informazioni sufficienti sulla sua evoluzione
Goals
Due sono gli obiettivi per la prima fase di questo progetto: 1) creare una mappa di regioni e siti specifici nel genoma SARS-CoV-2 che possano essere sfruttati per interventi terapeutici. 2) valutare se l'editing dell'RNA, una difesa innata contro i virus, sia rilevante per migliorare la risposta cellulare all'infezione. Background e Razionale L'identificazione di bersagli molecolari che possano essere sfruttati contro il SARS-CoV-2 passa attraverso l'acquisizione di conoscenze sulle proteine virali, sul loro ruolo e sul loro potenziale di diventare bersaglio per azioni di profilassi e terapia contro il virus. Di solito questo viene eseguito attraverso screening molecolari che caratterizzano e testano ogni componente virale. Un'altra opzione si basa sulla variabilità genetica naturale nell'interazione ospitepatogeno: la conoscenza del potenziale evolutivo del virus può essere sfruttata per identificare regioni in cui le mutazioni sono dannose. Tuttavia, nel caso di SARS-CoV-2 questa opzione è limitata (a) dal breve tempo trascorso dall'inizio dell'epidemia, per cui -nonostante i massicci sforzi di sequenziamento- non ci sono informazioni sufficienti sulla sua evoluzione
Start date of activity
01/09/2021
Keywords
RNA, SARS COV-2
Last update: 17/09/2024