Research project

PRIN 2017 - 2017HWPZZZ - Eva Maria Pinatel (DSB.AD008.534)

Thematic area

Biomedical sciences

Project area

Tecnologie Applicate alle Scienze Biomediche (DSB.AD008)

Structure responsible for the research project

Institute of biomedical technologies (ITB)

Project manager

EVAMARIA PINATEL
Phone number: 02 26422705
Email: eva.pinatel@itb.cnr.it

Abstract

L'infezione da virus respiratorio sinciziale (RSV) è correlata all'insorgenza di bronchioliti che, nei bambini con meno di 5 anni, possono causare ospedalizzazioni prolungate e decessi. La variabilità di sintomatologie riscontrata per questa malattia è spiegata solo in parte dai fattori di rischio attualmente considerati. Un nostro studio dimostra come le ospedalizzazioni per bronchiolite siano strettamente correlate all'incremento di PM10 nell'aria. Ipotizziamo dunque che l'esposizione a PM10 possa essere un fattore di rischio rilevante nel condizionare la produttività dell'infezione virale. Abbiamo individuato nel microbiota nasale, che vive contatto sia col PM10 che con l'ospite, il possibile mediatore degli effetti del PM10, per questo ci proponiamo di analizzare la sua composizione in individui sani ed affetti da bronchiolite con sintomatologia lieve e acuta. In parallelo analizzeremo la risposta immunitaria dell'ospite e correleremo i dati ottenuti coi livelli di esposizione al PM10, validando con esperimenti in vitro ed in vivo le correlazioni ottenute. Verranno così individuarti il ruolo e le modalità di interazione degli attori coinvolti nella patogenesi della bronchiolite

Goals

Il progetto si svilupperà a partire da un'analisi S16 di tamponi nasali prelevati in una coorte di 200 individui composta da 100 pazienti affetti da bronchiolite (caratterizzati in base alla gravità della sintomatologia presentata) e 100 controlli. Questa analisi ci permetterà di caratterizzare le principali tipologie di composizione del microbiota presenti nella coorte. Selezioneremo quindi 70 pazienti rappresentativi della variabilità totale per effettuare un'indagine metagenomica più approfondita, che ci permetterà di individuare le differenze specie specifiche presenti nella coorte. Infine, su in gruppo di 25-30 individui,equamente suddivisi fra sani e malati con sintomatologia lieve o acuta, effettueremo un'analisi metatrascrittomica basata su RNA-sequencing dei tamponi nasali, per individuare alterazioni di espressione genica del microbiota, ed un'analisi di espressione genica singola cellula, basata su scRNA-sequencing, per individuare le alterazioni di espressione genica indotte nell'ospite. Tutti I dati verranno poi correlati coi valori di esposizione al PM10 ai quali I pazienti sono esposti nel periodo pre-ospedalizzazione.

Start date of activity

31/05/2019

Keywords

Microbiota, Nasale, Bronchiolite

Last update: 10/12/2023