Research project

Analisi probabilistica di sequenze biologiche (DIT.AD021.083)

Thematic area

Engineering, ICT and technologies for energy and transportation

Project area

Matematica Applicata (DIT.AD021)

Structure responsible for the research project

Institute for applied mathematics "Mauro Picone" (IAC)

Project manager

DAVIDE VERGNI
Phone number: 0649937355
Email: davide.vergni@cnr.it

Abstract

Lo studio delle proprietà statistiche di sequenze biologiche è da qualche anno al centro di un fiorente campo di ricerche nell'ambito della bioinformatica. Uno degli scopi principali di tali analisi è cercare di fare chiarezza su quali componenti tra tutte quelle presenti in ogni sequenza biologica siano portatori di informazione e significato (che sia funzionale, evoluzionistico o strutturale) ovvero siano invece ascrivibili a mutazioni casuali e non significative.

Goals

Gli obiettivi principali di questo progetto di ricerca riguardano la determinazione di proprietà statistiche caratteristiche nelle sequenze biologiche, siano sequenze di dna, sequenze proteiche, o sequenze associate a un secondo livello di regolazione genica (la sequenza di metilazione per la regolazione epigenetica). Tali proprietà, in linea di principio, possono essere usate per caratterizzare quelle sequenze coinvolte in particolari processi. Particolare attenzione sarà posta allo studio delle caratteristiche statistiche delle sequenze assenti, i cosiddetti nullomeri, ossia quelle sequenze di una fissata lunghezza (sia di nucleotidi che di amminoacidi) che non sono realizzate in un particolare genoma. Tali sequenze sono usate sia in genomica forense, sia come potenziali generatori di peptidi assenti in natura che potrebbero avere un effetto citotossico anche su cellule tumorali.

Start date of activity

01/01/2019

Keywords

Bioinformatica, Sequenze biologiche

Last update: 28/11/2023