Analisi probabilistica di sequenze biologiche (DIT.AD021.083)
Thematic area
Engineering, ICT and technologies for energy and transportation
Project area
Matematica Applicata (DIT.AD021)Structure responsible for the research project
Institute for applied mathematics "Mauro Picone" (IAC)
Project manager
DAVIDE VERGNI
Phone number: 0649937355
Email: davide.vergni@cnr.it
Abstract
Lo studio delle proprietà statistiche di sequenze biologiche è da qualche anno al centro di un fiorente campo di ricerche nell'ambito della bioinformatica. Uno degli scopi principali di tali analisi è cercare di fare chiarezza su quali componenti tra tutte quelle presenti in ogni sequenza biologica siano portatori di informazione e significato (che sia funzionale, evoluzionistico o strutturale) ovvero siano invece ascrivibili a mutazioni casuali e non significative.
Goals
Gli obiettivi principali di questo progetto di ricerca riguardano la determinazione di proprietà statistiche caratteristiche nelle sequenze biologiche, siano sequenze di dna, sequenze proteiche, o sequenze associate a un secondo livello di regolazione genica (la sequenza di metilazione per la regolazione epigenetica). Tali proprietà, in linea di principio, possono essere usate per caratterizzare quelle sequenze coinvolte in particolari processi. Particolare attenzione sarà posta allo studio delle caratteristiche statistiche delle sequenze assenti, i cosiddetti nullomeri, ossia quelle sequenze di una fissata lunghezza (sia di nucleotidi che di amminoacidi) che non sono realizzate in un particolare genoma. Tali sequenze sono usate sia in genomica forense, sia come potenziali generatori di peptidi assenti in natura che potrebbero avere un effetto citotossico anche su cellule tumorali.
Start date of activity
01/01/2019
Keywords
Bioinformatica, Sequenze biologiche
Last update: 03/11/2024