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L'IGG ha nel suo complesso una importante rete di laboratori, alcuni dei quali dotati di apparecchiature uniche in Italia. Sono disponibili tra altri: una microsonda ionica, ICP-MS e spettrometro di massa a triplo-quadrupolo con ablazione laser, due microsonde elettroniche, uno spettrometro di ultima generazione per misure di età col metodo 40Ar/39Ar, spettrometri di massa per misure isotopiche di ossigeno, carbonio, elio, stronzio, neodimio, piombo e trizio, uno spettrometro di massa multicollettore Neptune, uno spettrometro di massa ICP/MS con gascromatografo per i fluidi, diffrattometri, fluorescenze a RX, e microscopi elettronici. I laboratori, oltre ad essere utilizzati per i compiti istituzionali, sono a disposizione della comunità scientifica essenzialmente attraverso collaborazioni; ma possono effettuare anche prestazioni per conto di terzi. I laboratori dell'Istituto, oltre a sviluppare nuove metodologie analitiche e strumentazioni, forniscono pure supporto analitico e logistico per campionamenti di fluidi e misure di parametri chimico-fisici alle varie linee di ricerca. Per lo svolgimento delle ricerche suddette, che (oltre ad analisi petrografiche e petrofisiche di minerali e rocce, nonchè analisi chimiche ed isotopiche di acque, gas e roccia) comporta anche indagini geofisiche, l'Istituto può contare inoltre su: attrezzature per misurare la temperatura in pozzi profondi fino a 2000 m; un sistema di magnetotellurica MT-V5; un gravimetro; e strumenti per la misura della conducibilità termica su campioni di rocce. Le attività di modellistica numerica includono simulatori tridimensionali di serbatoio geotermico (inclusa l'interazione fluido-roccia); modelli di simulazione della dinamica di acquiferi; modellistica dei processi geomorfologici e interazione acqua-sedimento; modelli della dinamica glaciale; modelli di trasporto; modelli SVAT di interazione suolo-vegetazione-atmosfera a scale diverse; modelli di simulazione di fluidi geofisici convettivi e/o rotanti; modelli di impatto al suolo dei cambiamenti climatici.