Research project

Convenzione di collaborazione scientifica tra CNR e Scuola Normale di Pisa (DFM.AD004.176)

Thematic area

Physical sciences and technologies of matter

Project area

Sistemi e materiali complessi, materia soffice, biofisica e reti (DFM.AD004)

Structure responsible for the research project

Institute of biophysics (IBF)

Project manager

ANGELO DIGARBO
Phone number: 050-3152577
Email: angelo.digarbo@pi.ibf.cnr.it

Abstract

L'analisi delle reti ha trovato moltissime applicazioni in campo biologico. Un tipo particolare di reti sono quelle formate da geni co-regolato. In questo tipo di approccio, due geni (nodi) sono collegati da un bordo se la correlazione nei loro livelli di espressione supera un valore soglia. Queste reti prendono il nome di reti di co-espessione genica (gene coexpression networks, GCN) e studi precedenti hanno mostrato come presentino caratteristiche tipiche di una legge di scala. Scopo del progetto è quello di studiare le GCN in un campione di 300 diversi datasets (no ancora pubblicati) di RNA-seq ottenuti nel pesce annuale Nothobranchius furzeri. Un altro ambito di ricerca riguarderà lo studio della stabilità strutturale del nerve growth factor (NGF) e proNGF utilizzando l'alta pressione come agente perturbante in diverse condizioni sperimentali (variazioni di temperatura, aggiunta di stabilizzanti e denaturanti). In aggiunta, queste misure permetteranno di ottenere delle informazioni sull'interazione del propeptide con NGF

Start date of activity

01/01/2014

Keywords

NGF, stabilità strutturale, reti genomiche

Last update: 04/12/2024