Journey to the cold and back: comparative genomics and transcriptomics in Antarctic and sub-Antarctic notothenioids (DBA.AD006.012)

Thematic area

Biology, agriculture and food sciences

Project area

Structure responsible for the research project

Institute of plant genetics (IBBR)

Project manager

VINCENZA VERDE
Phone number: 0816132710
Email: cinzia.verde@ibbr.cnr.it

Abstract

I nototenioidei sono un ampio gruppo di pesci filogeneticamente simili che si sono evoluti nelle acque antartiche e che dimostrano delle caratteristiche biochimiche e fisiologiche peculiari rispetto ai teleostei temperati. Il trasporto dell'ossigeno è uno dei processi fisiologici che ha subito i cambiamenti più rilevanti nei nototenioidei, fino alla perdita completa dell'emoglobina in alcune specie. Mentre i nototenioidei sono per la maggior parte specie endemiche dell'oceano del Sud, alcune specie sono successivamente migrate verso le acque sub-antartiche, ritornando a condizioni ambientali simili a quelle dei pesci che abitano le zone temperate. L'obiettivo principale del progetto è di ottenere una mole di dati caratterizzanti i trascrittomi dei nototenioidei in diverse condizioni fisiologiche/ecologiche. Mediante approccio comparativo, i risultati ottenuti permetteranno di valutare il ruolo dell'espressione genica e dell'evoluzione dei geni codificanti nel contesto dell'adattamento dei nototenioidei all'ambiente marino

Goals

A tal fine, il progetto applica metodiche di genomica e trascrittomica comparata ad alcune tra le più importanti specie di nototenioidei, diverse in termini di storia evolutiva, distribuzione geografica e condizioni fisiologiche/ecologiche.

Start date of activity

01/01/2018

Keywords

genomics, Antarctic, notothenioids

Last update: 17/05/2024