Progetto di ricerca

FORNITURA DI SERVIZI COMPUTAZIONALI SPECIALIZZATI (DCM.AD008.027)

Area tematica

Scienze chimiche e tecnologie dei materiali

Area progettuale

Modelling computazionale (DCM.AD008)

Struttura responsabile del progetto di ricerca

Istituto di Scienze e Tecnologie Chimiche "Giulio Natta" (SCITEC)

Responsabile di progetto

GIORGIO COLOMBO
Telefono: 0228500031
E-mail: giorgio.colombo@icrm.cnr.it

Abstract

I programmi ISABEL e REBELOT, implementazioni del programma BEPPE, sono metodi computazionali di decomposizione energetica che permettono di prevedere epitopi di target proteici e di individuare le regioni coinvolte nella comunicazione allosterica in proteine multidominio. Quindi, la loro applicazione è funzionale per investigare le basi molecolari del meccanismo di attivazione del proteosoma.
Il proteosoma umano è un complesso proteolitico multimerico, responsabile della degradazione di proteine e peptidi, svolgendo pertanto un ruolo chiave nel mantenimento dell'omeostasi cellulare. La patofisiologia di diversi tumori maligni è associata ad un'iperattività del proteosoma rendendolo un target farmacologico di grande interesse. Il nucleo centrale del proteosoma è formato da 28 subunità simmetricamente disposte in 4 anelli (±1-7,²1-7,²1-7,±1-7) in un arrangiamento cilindrico intorno ad un canale centrale attraverso il quale i substrati poliubiquitinati arrivano ai siti catalitici (chimotriptico, triptico e caspasico) localizzati a livello degli anelli beta.

Data inizio attività

07/11/2018

Parole chiave

epitopi, decomposizione energetica, proteine mono e multidominio

Ultimo aggiornamento: 08/12/2024