Consiglio Nazionale delle Ricerche

Tipo di prodottoArticolo in rivista
TitoloAgeWa: an integrated approach for antisense experiment design.
Anno di pubblicazione2002
Formato
  • Elettronico
  • Cartaceo
Autore/iArrigo P, Scartezzini P, Romano P
Affiliazioni autoriCNR ISMAC Genova E/O Ospedali Galliera Genova IST Genova
Autori CNR e affiliazioni
  • PATRIZIO ARRIGO
Lingua/e
  • inglese
AbstractOne of the major fallouts of the human genome project relates to the investigation of the molecular mechanisms of diseases. Identification of genes which are involved in a specific pathological process and characterization of their interactions is of fundamental importance for supporting the drug design processes. Discovery of targets and the related experimental validation is a critical step in the development of new drugs. The new experimental methods for gene expression analysis, such as microarray technology, allows for the concurrent evaluation of the expression of multiple genes. The outcome of these new experimental methods requires a subsequent validation of the gene function by using in vitro or in vivo models. In the last decade, one of the most promising methodologies for the investigation of gene function relies upon antisense oligonucleotides (ASO). The crucial step in antisense experiment design is the characterization of the nucleotide domains that can efficiently be targeted by this kind of synthetic molecule. At present, no standardized procedures for target selection are available. In this paper, we propose an integrative approach to ASO target selection: the proposed tool Automatic Gene Walk (AgeWa) combines a neural filter with database mining for the prediction of the optimal target for antisense action.
Lingua abstractinglese
Altro abstract-
Lingua altro abstract-
Pagine da167
Pagine a171
Pagine totali5
RivistaIEEE transactions on nanobioscience
Attiva dal 2002
Editore: Institute of Electrical and Electronics Engineers, - Piscataway, NJ
Paese di pubblicazione: Stati Uniti d'America
Lingua: inglese
ISSN: 1536-1241
Titolo chiave: IEEE transactions on nanobioscience
Titolo proprio: IEEE transactions on nanobioscience.
Titolo abbreviato: IEEE trans. nanobiosci.
Numero volume della rivista1
Fascicolo della rivista4
DOI10.1109/TNB.2003.809462
Verificato da refereeSì: Internazionale
Stato della pubblicazione-
Indicizzazione (in banche dati controllate)-
Parole chiaveASO, RNA inteference, neural networks
Link (URL, URI)-
Titolo parallelo-
Licenza-
Scadenza embargo-
Data di accettazione-
Note/Altre informazioni-
Strutture CNR
  • ISMAC — ISMAC - Sede secondaria di Genova
Moduli/Attività/Sottoprogetti CNR
  • SV.P14.001.001 : Interazione proteine-acidi nucleici e farmacogenomica
Progetti Europei-
Allegati

Dati associati a vecchie tipologie
I dati associati a vecchie tipologie non sono modificabili, derivano dal cambiamento della tipologia di prodotto e hanno solo valore storico.
Editore
  • IEEE, New York (Stati Uniti d'America)