Profilo personale

Saverio Vicario

Le informazioni pubblicate in questa pagina sono gestite in completa autonomia da SAVERIO VICARIO il/la quale se ne assume ogni responsabilità

Saverio Vicario é un ricercatore del CNR, a Bari dal 2006 e con contratto a tempo indeterminato dal 2011, precedentemente presso CNR-ITB, attualmente presso CNR-IIA. Laurea in Zoologia presso l'Università degli stud di Roma "TorVergata" e Dottorato in evoluzione ed ecologia presso la Yale University (CT, USA) con tesi sull'uso comparato dei codoni nell'insieme dei geni codificanti di 12 specie di Drosophila. Il suo lavoro di ricerca ha prodotto articoli peer reviewed con argomento sistematica molecolare, evoluzione del genoma, biodiversità e infrastrutture di calcolo per lo studio della biodiversità. Più recentemente l'interesse si è spostato sulla entropia filogenetica (misura correlata all'indice di entropia Shannon-Weaver) e alla possibilità di correlare la struttura filogenetica delle comunità con variabili ambientali inserendo il problema nel quadro risolutivo/inferenziale proposto dalla Teoria dell'Informazione. Il lavoro sulle infrastrutture informative e di calcolo per la biodiversità si è svolto da un punto di vista tecnico nell'ambito del progetto FP7 BioVeL, mentre da un punto di vista di coordinamento delle comunità di utenti e definizioni degli standard nel progetto Fp7 Creative-B. Il lavoro di interscambio di e accesso ad algoritmi e software del progetto BioVeL ha esplorato l'uso di motori di processi ("workflow engine"), di accesso al calcolo mediante web services e di condivisione dei codici sorgenti (usando IPython, myExperiment e RStudio). Da un punto di vista più strettamente biologico il lavoro si è caratterizzato dallo studio dell'evoluzione del genoma nucleare e mitocondriale nelle regioni codificanti proteine rispetto all'uso dei codoni e al rapporto tra mutazioni sinonime e non sinomime. Questo studio è stato applicato in particolare a stabilire le traiettorie evolutive nel genoma mitocondriale. E' stato parte dello sforzo italiano per la costruzione dell'infrastruttura di ricerca LifeWatch ed è membro della SIBE ( società italiana di biologia evoluzionistica) e della BITS (Società Italiana di Bioinformatica)

Aree di interesse:

Bioinformatica: Entropia filogenetica Principi e pratica della selezione e della stima della adeguatezza di modelli statistici in un approccio di verosimiglianza bayesiana e frequentista. metodi filogenetic, distanze tra alberi filogenetici, diversità filogenetica.
Stima di parametri di evoluzione molecolare come dS/dN, tassi di sostituzione, tempi di divergenza assoluti e relativi.
Evoluzione Molecolare: Analisi dell'uso dei Codoni Evoluzione del genoma mitocondriale


Identificatori Internazionali

Scopus Author ID: 6602779982
WoS Researcher ID: C-4427-2015
Research Gate: Saverio_Vicario

Prodotti della ricerca

Cristina Tarantino (1); Luigi Forte (2)(3); Palma Blonda (1); Saverio Vicario (1); Valeria Tomaselli (2); Carl Beierkuhnlein (4)(5)(6); Maria Adamo (1)

Intra-annual sentinel-2 time-series supporting grassland habitat discrimination

(2021) in Remote sensing (Basel)
Maria Adamo 1,*, Valeria Tomaselli 2,3, Cristina Tarantino 1 , Saverio Vicario 1 , Giuseppe Veronico 3 , Richard Lucas 4 and Palma Blonda 1

Knowledge-Based Classification of Grassland Ecosystem Based on Multi-Temporal WorldView-2 Data and FAO-LCCS Taxonomy

Maria Adamo 1,*, Valeria Tomaselli 2,3, Cristina Tarantino 1 , Saverio Vicario 1 , Giuseppe Veronico 3 (2020) in Remote sensing (Basel)
Saverio Vicario (1), Maria Adamo (1), Domingo Alcaraz-Segura (2)(3), Cristina Tarantino (1)

Bayesian Harmonic Modelling of Sparse and Irregular Satellite Remote Sensing Time Series of Vegetation Indexes: A Story of Clouds and Fires

(2020) in Remote sensing (Basel)
Saverio Vicario , Francesco Lovergine, Nicola Mosca, Vito Renò, Marica Antonacci, Giacinto Donvito , Matteo Santoro , Paolo Mazzetti

PHYLOHGEO-WS: VISUALIZATION AND DATA EXPLORATION OF COMMUNITY BIODIVERSITY IN A PHYLOGENETIC-GEOSPATIAL CONTEXT

Saverio Vicario , Francesco Lovergine, Nicola Mosca, Vito Renò, Marica (2020) DATA CENTER ReCaS, Bari, 12/07/2019
Balech, Bachir; Sandionigi, Anna; Manzari, Caterina; Trucchi, Emiliano; Tullo, Apollonia; Licciulli, Flavio; Grillo, Giorgio; Sbisa, Elisabetta; De Felici, Stefano; Saccone, Cecilia; D'Erchia, Anna Maria; Cesaroni, Donatella; Casiraghi, Maurizio; Vicario, Saverio

Tackling critical parameters in metazoan meta-barcoding experiments: a preliminary study based on coxI DNA barcode

(2018) in PeerJ
Balech B.; Monaco A.; Perniola M.; Santamaria M.; Donvito G.; Vicario S.; Maggi G.; Pesole G.

DNA multiple sequence alignment guided by protein domains: The MSA-PAD 2.0 method

(2018) in Methods in molecular biology (Clifton N.J.)
Matthias Obst 1, Saverio Vicario 2 , Kennet Lundin 3, Matz Berggren 1, Anna Karlsson 4, Robert Haines 5, Alan Williams 5, Carole Goble 5, Cherian Mathew 6, Anton Güntsch 6,

Marine long-term biodiversity assessment suggests loss of rare species in the Skagerrak and Kattegat region

(2017) in Marine biodiversity (Internet)
Bruno, Antonia; Sandionigi, Anna; Rizzi, Ermanno; Bernasconi, Marzia; Vicario, Saverio; Galimberti, Andrea; Cocuzza, Clementina; Labra, Massimo; Casiraghi, Maurizio

Exploring the under-investigated "microbial dark matter" of drinking water treatment plants

(2017) in Scientific reports (Nature Publishing Group)
Benazzo, Andrea; Trucchi, Emiliano; Cahill, James A; Maisano Delser, Pierpaolo; Mona, Stefano; Fumagalli, Matteo; Bunnefeld, Lynsey; Cornetti, Luca; Ghirotto, Silvia; Girardi, Matteo; Ometto, Lino; Panziera, Alex; Rota-Stabelli, Omar; Zanetti, Enrico; Karamanlidis, Alexandros; Groff, Claudio; Paule, Ladislav; Gentile, Leonardo; Vila, Carles; Vicario, Saverio; Boitani, Luigi; Orlando, Ludovic; Fuselli, Silvia; Vernesi, Cristiano; Shapiro, Beth; Ciucci, Paolo; Bertorelle, Giorgio

Survival and divergence in a small group: The extraordinary genomic history of the endangered Apennine brown bear stragglers.

(2017) in Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
De Fanti, Sara; Vicario, Saverio; Lang, Martin; Simone, Domenico; Magli, Cristina; Luiselli, Donata; Gianaroli, Luca; Romeo, Giovanni

Intra-individual purifying selection on mitochondrial DNA variants during human oogenesis.

(2017) in Human reproduction (Oxf., Online)
Visualizza ulteriori prodotti