Progetto di ricerca

Convenzione di collaborazione scientifica tra CNR e Scuola Normale di Pisa (DFM.AD004.176)

Area tematica

Scienze fisiche e tecnologie della materia

Area progettuale

Sistemi e materiali complessi, materia soffice, biofisica e reti (DFM.AD004)

Struttura responsabile del progetto di ricerca

Istituto di biofisica (IBF)

Responsabile di progetto

ANGELO DIGARBO
Telefono: 050-3152577
E-mail: angelo.digarbo@pi.ibf.cnr.it

Abstract

L'analisi delle reti ha trovato moltissime applicazioni in campo biologico. Un tipo particolare di reti sono quelle formate da geni co-regolato. In questo tipo di approccio, due geni (nodi) sono collegati da un bordo se la correlazione nei loro livelli di espressione supera un valore soglia. Queste reti prendono il nome di reti di co-espessione genica (gene coexpression networks, GCN) e studi precedenti hanno mostrato come presentino caratteristiche tipiche di una legge di scala. Scopo del progetto è quello di studiare le GCN in un campione di 300 diversi datasets (no ancora pubblicati) di RNA-seq ottenuti nel pesce annuale Nothobranchius furzeri. Un altro ambito di ricerca riguarderà lo studio della stabilità strutturale del nerve growth factor (NGF) e proNGF utilizzando l'alta pressione come agente perturbante in diverse condizioni sperimentali (variazioni di temperatura, aggiunta di stabilizzanti e denaturanti). In aggiunta, queste misure permetteranno di ottenere delle informazioni sull'interazione del propeptide con NGF

Data inizio attività

01/01/2014

Parole chiave

NGF, stabilità strutturale, reti genomiche

Ultimo aggiornamento: 29/03/2024