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Progetto INT.P02
Bioinformatica

Attività

Le principali attività svolte
Il progetti Interdipartimentale CNR-Bioinformatics è stato attivato solo recentemente a partire dal 2007. Nel corso del primo anno di attività sono stati pubblicati 54 articoli scientifici su riviste internazionali, circa un centinaio partecipazioni a congressi del settore. Il progetto ha partecipato a 7 progetti Nazionali e 6 progetti Internazionali. Si sono realizzati 8 pacchetti software e sono stati iniziati 8 dottorati. Sono state coordinate 2 scuole internazionali e avviati 3 progetti europei nel 7° programma quadro.

Le attività previste
In particolare saranno previste le seguenti attività: Sviluppo di metodi per la previsione del folding e misfolding di proteine; Previsione e Caratterizzazione di fenomeni di local-folding-unfolding in proteine dalla struttura nota e coinvolte in vie metaboliche rilevanti per lo sviluppo di tumori; Sviluppo razionale di nuove molecole con attività farmacologica per il controllo dei fenomeni di mis-folding, e per l'interazione con recettori flessibili; Sviluppo di metodi di focusing di drug-libraries; Sviluppo di nuovi metodi di virtual screenign basati sul profiling delle conformazioni dei recettori. Sviluppo e applicazione di nuovi metodi teorici per lo studio di processi di riconoscimento molecolare. Definizione di modelli di self-assembly di peptidi e di riconoscimento molecolare recettore-legante. Sviluppo di programmi di computational biology-bioinformatics per il design e l’identificazione attraverso virtual screening di nuovi farmaci. Implementazione, la valutazione e l'applicazione di metodi e modelli robotici per l'apprendimento e il growing up; Sviluppo di sistemi di controllo distribuiti per sistemi multiagenti operanti in ambienti parzialmente strutturati; Formulazione di modelli della dinamica di reti di regolazione genica; Sviluppo e implementazione di metodi per l'analisi e la simulazione qualitativa di modelli di reti di regolazione; Studio di sistemi di regolazione biologica; Sviluppo di Data Mining di dati di pazienti con malattie genetiche per l'individuazione di nuove correlazioni tra fenotipi e dati a livello genetico, molecolare e di tessuto; Sviluppo di algoritmi per il confronto strutturale di proteine e per la previsione della struttura tridimensionale; Identificazione e analisi dei modelli dinamici di reti biologiche per la system Biology. Sviluppo di database per il trattamento delle mutazioni geniche e SNP. Sviluppo di metodologie per lo studio di genetica di popolazioni.

Parole chiave
Bioinformatica    System Biology    Genomica

 
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