Consiglio Nazionale delle Ricerche

Tipo di prodottoArticolo in rivista
TitoloA mathematical model for the validation of gene selection methods
Anno di pubblicazione2011
FormatoCartaceo
Autore/iM. Muselli, A. Bertoni, M. Frasca, A. Beghini, F. Ruffino, G. Valentini
Affiliazioni autoriM. Muselli: CNR-IEIIT; A. Bertoni: DSI, Dipartimento di Scienze dell'Informazione, Università degli Studi di Milano; M. Frasca: DSI, Dipartimento di Scienze dell'Informazione, Università degli Studi di Milano; A. Beghini: Dipartimento di Biologia e Genetica per le Scienze Mediche, Università degli Studi di Milano; F. Ruffino: DSI, Dipartimento di Scienze dell'Informazione, Università degli Studi di Milano; G. Valentini: DSI, Dipartimento di Scienze dell'Informazione, Università degli Studi di Milano.
Autori CNR e affiliazioni
  • MARCO MUSELLI
Lingua/e
  • inglese
AbstractGene selection methods aim at determining biologically relevant subsets of genes in DNA microarray experiments. However, their assessment and validation represent a major difficulty since the subset of biologically relevant genes is usually unknown. To solve this problem a novel procedure for generating biologically plausible synthetic gene expression data is proposed. It is based on a proper mathematical model representing gene expression signatures and expression profiles through Boolean threshold functions. The results show that the proposed procedure can be successfully adopted to analyze the quality of statistical and machine learning-based gene selection algorithms.
Lingua abstractinglese
Altro abstract-
Lingua altro abstract-
Pagine da1385
Pagine a1392
Pagine totali8
RivistaIEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics (Print)
Attiva dal 2004
Editore: IEEE Computer Society, - New York, NY
Paese di pubblicazione: Stati Uniti d'America
Lingua: inglese
ISSN: 1545-5963
Titolo chiave: IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics (Print)
Titolo proprio: IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics (Print)
Titolo abbreviato: IEEE/ACM trans. comput. biol. bioinform. (Print)
Titoli alternativi:
  • Computational biology and bioinformatics (Print)
  • Transactions on computational biology and bioinformatics (Print)
  • IEEE/ACM TCBB (Print)
  • IEEE transactions on computational biology and bioinformatics (Print)
Numero volume della rivista8
Fascicolo della rivista5
DOI10.1109/TCBB.2010.83
Verificato da refereeSì: Internazionale
Stato della pubblicazione-
Indicizzazione (in banche dati controllate)
  • PubMed (Codice:21778526)
  • Scopus (Codice:2-s2.0-79960905271)
  • ISI Web of Science (WOS) (Codice:000292681800019)
Parole chiavemachine learning, bioinformatics, genomics
Link (URL, URI)-
Titolo parallelo-
Data di accettazione-
Note/Altre informazioni-
Strutture CNR
  • IEIIT — Istituto di elettronica e di ingegneria dell'informazione e delle telecomunicazioni
Moduli CNR
    Progetti Europei-
    Allegati
    • Articolo pubblicato

    Dati associati a vecchie tipologie
    I dati associati a vecchie tipologie non sono modificabili, derivano dal cambiamento della tipologia di prodotto e hanno solo valore storico.
    Editore
    • IEEE, Institute of electrical and electronics engineers, New York (Stati Uniti d'America)

    Dati storici
    I dati storici non sono modificabili, sono stati ereditati da altri sistemi (es. Gestione Istituti, PUMA, ...) e hanno solo valore storico.
    Area disciplinareComputer Science & Engineering
    Area valutazione CIVRIngegneria industriale e informatica
    Rivista ISIIEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS [00613NN]
    Note