Consiglio Nazionale delle Ricerche

Tipo di prodottoArticolo in rivista
TitoloGene expression modeling through positive Boolean functions
Anno di pubblicazione2008
Formato-
Autore/iF. Ruffino; M. Muselli; G. Valentini
Affiliazioni autoriF. Ruffino, G. Valentini: DSI, Dipartimento di Scienze dell'Informazione, Università degli Studi di Milano, Via Comelico 39, Milano, Italy, M. Muselli CNR IEIIT Genova
Autori CNR e affiliazioni
  • MARCO MUSELLI VQR
Lingua/e
  • inglese
AbstractIn the framework of gene expression data analysis, the selection of biologically relevant sets of genes and the discovery of new subclasses of diseases at bio-molecular level represent two significant problems. Unfortunately, in both cases the correct solution is usually unknown and the evaluation of the performance of gene selection and clustering methods is difficult and in many cases unfeasible. A natural approach to this complex issue consists in developing an artificial model for the generation of biologically plausible gene expression data, thus allowing to know in advance the set of relevant genes and the functional classes involved in the problem. In this work we propose a mathematical model, based on positive Boolean functions, for the generation of synthetic gene expression data. Despite its simplicity, this model is sufficiently rich to take account of the specific peculiarities of gene expression, including the biological variability, viewed as a sort of random source. As an applicative example, we also provide some data simulations and numerical experiments for the analysis of the performances of gene selection methods.
Lingua abstractinglese
Altro abstract-
Lingua altro abstract-
Pagine da97
Pagine a108
Pagine totali-
RivistaInternational journal of approximate reasoning
Attiva dal 1987
Editore: North-Holland, - [New York, N.Y.]
Paese di pubblicazione: Paesi Bassi
Lingua: inglese
ISSN: 0888-613X
Titolo chiave: International journal of approximate reasoning
Titolo proprio: International journal of approximate reasoning
Titolo abbreviato: Int. j. approx. reason.
Numero volume della rivista47
Fascicolo della rivista1
DOI10.1016/j.ijar.2007.03.010
Verificato da refereeSì: Internazionale
Stato della pubblicazione-
Indicizzazione (in banche dati controllate)
  • ISI Web of Science (WOS) (Codice:000251927600009)
  • Scopus (Codice:2-s2.0-36248971792)
Parole chiavegene expression modeling, gene selection, gene expression data clustering, positive Boolean functions, DNA microarrays
Link (URL, URI)-
Titolo parallelo-
Data di accettazione-
Note/Altre informazioni-
Strutture CNR
  • IEIIT — Istituto di elettronica e di ingegneria dell'informazione e delle telecomunicazioni
Moduli CNR
    Progetti Europei-
    Allegati
    • Articolo pubblicato

    Dati associati a vecchie tipologie
    I dati associati a vecchie tipologie non sono modificabili, derivano dal cambiamento della tipologia di prodotto e hanno solo valore storico.
    Editore
    • Elsevier Science Inc., New York (Stati Uniti d'America)

    Dati storici
    I dati storici non sono modificabili, sono stati ereditati da altri sistemi (es. Gestione Istituti, PUMA, ...) e hanno solo valore storico.
    Rivista ISIINTERNATIONAL JOURNAL OF APPROXIMATE REASONING [10321J0]