@prefix pubblicazioni: . @prefix unitaDiPersonaleInterno: . @prefix prodotto: . unitaDiPersonaleInterno:MATRICOLA608 pubblicazioni:autoreCNRDi prodotto:ID308509 . @prefix prodottidellaricerca: . @prefix istituto: . istituto:CDS064 prodottidellaricerca:prodotto prodotto:ID308509 . unitaDiPersonaleInterno:MATRICOLA8556 pubblicazioni:autoreCNRDi prodotto:ID308509 . @prefix modulo: . modulo:ID8463 prodottidellaricerca:prodotto prodotto:ID308509 . @prefix rdf: . @prefix retescientifica: . prodotto:ID308509 rdf:type retescientifica:ProdottoDellaRicerca , prodotto:TIPO1302 . @prefix rdfs: . prodotto:ID308509 rdfs:label "Nuove piattaforme genomiche per l'identificazione di geni coinvolti nei processi di degradazione degli idrocarburi policiclici aromatici (Abstract/Poster in atti di convegno)"@en . @prefix xsd: . prodotto:ID308509 pubblicazioni:anno "2012-01-01T00:00:00+01:00"^^xsd:gYear . @prefix skos: . prodotto:ID308509 skos:altLabel "
Di Matteo A., Monti M.M., Pedata P.A, Sellitto S., Di Mauro D., Van Der Lee T.A.J., Rao M.A., Testa A. (2012)
Nuove piattaforme genomiche per l'identificazione di geni coinvolti nei processi di degradazione degli idrocarburi policiclici aromatici
in X Convegno AISSA, Palermo, 28-29 novembre 2012
"^^rdf:HTML ; pubblicazioni:autori "Di Matteo A., Monti M.M., Pedata P.A, Sellitto S., Di Mauro D., Van Der Lee T.A.J., Rao M.A., Testa A."^^xsd:string ; pubblicazioni:paginaInizio "25"^^xsd:string ; pubblicazioni:titoloVolume "Acta Italus Hortus Book of abstract del X Convegno AISSA \\\"La valorizzazione del territorio agrario e il controllo del degrado del suolo\\\""^^xsd:string ; skos:note "Abstract"^^xsd:string ; pubblicazioni:affiliazioni "Di Matteo A., Sellitto S., Di Mauro D., Rao M. A., Testa A. - Universit\u00E0 degli Studi di Napoli Federico II, Dip. Agraria\nVan Der Lee T. A. J. Wageningen UR, Plant Research International, Department Bio-Interactions and Plant Health, The Netherlands"^^xsd:string ; pubblicazioni:titolo "Nuove piattaforme genomiche per l'identificazione di geni coinvolti nei processi di degradazione degli idrocarburi policiclici aromatici"^^xsd:string ; pubblicazioni:isbn "9788890562839"^^xsd:string ; prodottidellaricerca:abstract "Gli idrocarburi policiclici aromatici (IPA) sono una classe di diverse centinaia di composti\ncontenenti almeno due anelli aromatici condensati che sono noti per essere tossici, mutageni,\ncancerogeni e teratogenici. Sono inquinanti comuni nell'ambiente, in particolare in siti produttivi\nquali aree di stoccaggio di carburanti e vecchi siti industriali. Hanno una bassa biodegradabilita\nbiochimica intrinseca determinata principalmente dalla loro forte idrofobicita, da cio il\nbioaccumulo e la bioamplificazione verso i livelli piu alti della catena trofica fino all'uomo. Molti\norganismi tra cui piante, batteri, funghi, ed insetti, sono in grado di vivere e, in alcuni casi, di\nprosperare in presenza di inquinanti grazie alla loro capacita degradativa. Infatti, un corredo\nenzimatico adeguato puo modificare la struttura dell'inquinante fino a degradarne la molecola in\nprodotti di reazione non tossici. L'identificazione di geni e processi metabolici coinvolti nella\ndegradazione degli IPA potrebbe essere utilizzata per l'ottenimento di proteine ricombinanti ed\norganismi ingegnerizzati per lo sviluppo di nuovi sistemi di biorisanamento. A tale scopo, alcune\nspecie fungine selezionate in un suolo contaminato con IPA sono state isolate e caratterizzate\nmediante profilo ISSR. Un ceppo di Byssoclamis nivea ha mostrato una rilevante attivita\ndegradativa in vitro nei confronti degli IPA. La carenza di informazioni circa la sequenza di DNA e\nRNA in B. nivea rappresenta un grave limite alla implementazione di approcci biotecnologici in\nquesta specie. Per questo motivo, dall'RNA totale isolato da micelio di B. nivea cresciuto in diverse\ncondizioni ambientali (pH, temperatura, intensita luminosa, concentrazioni di IPA) e stata prodotta\nuna libreria normalizzata di frammenti 3 di cDNA. Questa libreria e stata sequenziata mediante\ntecnologia 454-FLX e l'assembling delle reads ha prodotto 34880 contigs e 88400 sequenze\nsingole. Tra tutti, un numero di mRNA annotati come glutatione S-transferasi, monossigenasi P450\ne diossigenasi ha mostrato una maggiore espressione in presenza di IPA. Questi geni sono stati\nselezionati per la loro capacita di essere espressi nel lievito Yarrowia lipolytica ed in piante di\ntabacco. Geni coinvolti nei meccanismi di resistenza/tolleranza ai PCP sono stati ricercati anche\nnell'insetto modello Drosophila melanogaster. In particolare, larve di terza eta sono state trattate\ncon tre dosi (0, 20 e 2000 ppm) di PCP. L'RNA totale da esse purificato e stato utilizzato in un\napproccio di trascrittomica comparativa mediante ibridazione su un chip microarray 90k prodotto\ncon tecnologia CombiMatrix. Sui microelettrodi del chip sono state sintetizzate 30.000 sonde\nunivoche specifiche per altrettanti Tentative Consensus acquisite dal Gene Index Database di\nDrosophila versione 12. L'approccio ha consentito di identificare nuovi geni candidati coinvolti\nnella risposta dell'insetto allo stress da PCP. Ulteriori caratterizzazioni funzionali di geni candidati\nisolati dai modelli di fungo ed insetto utilizzati forniranno nuove informazioni sui meccanismi\nmolecolari e processi coinvolti nella detossificazione di contaminanti pericolosi. Inoltre, la\ncaratterizzazione di lieviti artificiali e piante si prevede fornisca indicazioni supplementari per\nl'attuazione di nuovi sistemi per la bonifica, in ambiente confinato, delle acque del suolo."@it ; prodottidellaricerca:prodottoDi modulo:ID8463 , istituto:CDS064 ; pubblicazioni:autoreCNR unitaDiPersonaleInterno:MATRICOLA608 , unitaDiPersonaleInterno:MATRICOLA8556 .