@prefix pubblicazioni: . @prefix unitaDiPersonaleInterno: . @prefix prodotto: . unitaDiPersonaleInterno:MATRICOLA29226 pubblicazioni:autoreCNRDi prodotto:ID27938 . @prefix prodottidellaricerca: . @prefix istituto: . istituto:CDS041 prodottidellaricerca:prodotto prodotto:ID27938 . unitaDiPersonaleInterno:MATRICOLA8809 pubblicazioni:autoreCNRDi prodotto:ID27938 . @prefix rdf: . prodotto:ID27938 rdf:type prodotto:TIPO1101 . @prefix retescientifica: . prodotto:ID27938 rdf:type retescientifica:ProdottoDellaRicerca . @prefix rdfs: . prodotto:ID27938 rdfs:label "Organelle DNA analysis of Solanum and Brassica somatic hybrids by PCR with 'Universal Primers' (Articolo in rivista)"@en . @prefix xsd: . prodotto:ID27938 pubblicazioni:anno "2001-01-01T00:00:00+01:00"^^xsd:gYear ; pubblicazioni:doi "10.1007/s001220000508"^^xsd:string . @prefix skos: . prodotto:ID27938 skos:altLabel "
Bastia T., Scotti N., Cardi T (2001)
Organelle DNA analysis of Solanum and Brassica somatic hybrids by PCR with 'Universal Primers'
in Theoretical and applied genetics
"^^rdf:HTML ; pubblicazioni:autori "Bastia T., Scotti N., Cardi T"^^xsd:string ; pubblicazioni:paginaInizio "1265"^^xsd:string ; pubblicazioni:paginaFine "1272"^^xsd:string ; pubblicazioni:numeroVolume "102"^^xsd:string . @prefix ns10: . prodotto:ID27938 pubblicazioni:rivista ns10:ID599283 ; pubblicazioni:note "IF 2001: 2.438 Bastia T.: Borsista CNR durante l'esecuzione degli esperimenti"^^xsd:string ; pubblicazioni:descrizioneSinteticaDelProdotto "Il lavoro verifica la possibilit\u00E0 di utilizzare oligonuleotidi \\\"universali\\\" per l'amplificazione di sequenze geniche dei genomi citoplasmatici vegetali allo scopo di mettere a punto un metodo rapido per la determinazione della variabilit\u00E0 nei genomi citoplasmatici in ibridi somatici di Solanum e Brassica spp."^^xsd:string ; skos:note "ISI Web of Science (WOS)"^^xsd:string ; pubblicazioni:affiliazioni "CNR-IMOF, Research Institute for Vegetable and Ornamental Plant Breeding, via Universit\u00E0 133, 80055 Portici, Italy. (ora CNR-IGV, Istituto di Genetica Vegetale, Sez. Portici)"^^xsd:string ; pubblicazioni:titolo "Organelle DNA analysis of Solanum and Brassica somatic hybrids by PCR with 'Universal Primers'"^^xsd:string ; prodottidellaricerca:abstract "In order to set up a quick and easy procedure for determining the cytoplasmic composition of somatic hybrids, we tested a set of \u0091universal primers\u0092 for plastidial and mitochondrial DNA on 13 genotypes belonging to the following species: Nicotiana tabacum, Solanum commersonii, S. tuberosum, S. etuberosum, S. phureja, Brassica oleracea, B. rapa, \u0091Anand\u0092 CMS B. rapa, \u0091Chiang\u0092 CMS B. oleracea, \u0091Ogura\u0092 CMS B. oleracea. Such primers are homologous to conserved coding sequences and amplify polymorphic intergenic or intronic regions. cpDNA polymorphism within Solanum and Brassica spp. was found with two and four primer pairs, respectively. The primers for the intergenic region between the trnF and trnV genes gave polymorphism among several tested species and were used in S. commersonii (+) S. tuberosum somatic hybrids, and B. oleracea (+) \u0091Anand\u0092 CMS B. rapa cybrids. Two primer pairs for mtDNA revealed polymorphism between S. commersonii and S. tuberosum, and one showed intraspecific polymorphism in S. tuberosum. The primer pair for the intergenic region between rps14 and cob genes (pumD) showed a fragment of about 1.5 kb in S. tuberosum and S. phureja. A shorter fragment and no amplification were found in S. etuberosum and S. commersonii, respectively, suggesting frequent intrageneric rearrangements in this genome region. All Brassicaceae evidenced a fragment about 150 bp longer than in S. tuberosum. The same primers were also used with interspecific Solanum spp. somatic hybrids. Both PCR with pumD primers and hybridization with rpl5/rps14 genes indicated lack of linkage between rpl5/rps14 and cob genes in S. commersonii. Compared to direct visualization of restricted organellar DNA or Southern analysis with labelled probes, amplification of cp and mtDNA with universal primers, followed by electrophoresis of either entire or restricted amplified fragments, is a simpler, more rapid and less expensive method to determine the organelle genome composition of interspecific Solanum and Brassica somatic hybrids." ; prodottidellaricerca:prodottoDi istituto:CDS041 ; pubblicazioni:autoreCNR unitaDiPersonaleInterno:MATRICOLA8809 , unitaDiPersonaleInterno:MATRICOLA29226 . @prefix parolechiave: . prodotto:ID27938 parolechiave:insiemeDiParoleChiave . ns10:ID599283 pubblicazioni:rivistaDi prodotto:ID27938 . parolechiave:insiemeDiParoleChiaveDi prodotto:ID27938 .