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Istituto di scienza dell'alimentazione

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Contributo in rivista

Tipo: Articolo in rivista

Titolo: CALCOM: A software for calculating the center of mass of proteins.

Anno di pubblicazione: 2008

Formato: Elettronico

Autori: Costantini S, Paladino A, Facchiano AM.

Affiliazioni autori: CNR-ISA

Autori CNR:

  • SUSAN COSTANTINI
  • ANGELO FACCHIANO
  • ANTONELLA PALADINO

Abstract: The center of mass of a protein is an artificial point useful for detecting important and simple features of proteins structure, shape and association.CALCOM is a software which calculates the center of mass of a protein, starting from PDB protein structure files. In the case of protein complexes and of protein-small ligand complexes, the position of protein residues or of ligand atoms respect to each protein subunit can be evaluated, as well as the distance among the center of mass of the protein subunits, in order to compare different conformations and evaluate the relative motion of subunits. AVAILABILITY: THE SERVICE IS AVAILABLE AT THE URL: http://bioinformatica.isa.cnr.it/CALCOM/.

Pagine da: 271

Pagine a: 272

Rivista:

Bioinformation Biomedical Informatics Pvt Ltd
Paese di pubblicazione: India
Lingua: inglese
ISSN: 0973-2063

Numero volume: 2

Referee: Sė: Internazionale

Indicizzato da: PubMed [18478078]

Strutture CNR:

Moduli:

 
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